NCCOOS Trac Projects: Top | Web | Platforms | Processing | Viz | Sprints | Sandbox | (Wind)

Changeset 513

Show
Ignore:
Timestamp:
01/13/14 16:53:59
Author:
cbc
Message:

Add raw and reference counts to Ecopuck Level 1 processing.

Files:

Legend:

Unmodified
Added
Removed
Modified
Copied
Moved
  • gliderproc/trunk/gliderEcopuck_Generate_L1_Data.m

    r512 r513  
    6262        cdom = []; 
    6363        scatter = []; 
     64        chlor_sig = []; 
     65        cdom_sig = []; 
     66        scatter_sig = []; 
     67        chlor_ref = []; 
     68        cdom_ref = []; 
     69        scatter_ref = []; 
    6470        ptime_ebd = []; 
    6571         
     
    6773        switch gliderIndex 
    6874            case 1 % Pelagia 
    69                 chlor_name     = 'sci_bbfl2s_chlor_scaled'; 
    70                 cdom_name      = 'sci_bbfl2s_cdom_scaled'; 
    71                 scatter_name   = 'sci_bbfl2s_bb_scaled'; 
     75                chlor_name       = 'sci_bbfl2s_chlor_scaled'; 
     76                cdom_name        = 'sci_bbfl2s_cdom_scaled'; 
     77                scatter_name     = 'sci_bbfl2s_bb_scaled'; 
     78                chlor_sig_name   = 'sci_bbfl2s_chlor_sig'; 
     79                cdom_sig_name    = 'sci_bbfl2s_cdom_sig'; 
     80                scatter_sig_name = 'sci_bbfl2s_bb_sig'; 
     81                chlor_ref_name   = 'sci_bbfl2s_chlor_ref'; 
     82                cdom_ref_name    = 'sci_bbfl2s_cdom_ref'; 
     83                scatter_ref_name = 'sci_bbfl2s_bb_ref'; 
    7284            case 2 % Ramses 
    73                 chlor_name     = 'sci_flbbcd_chlor_units'; 
    74                 cdom_name      = 'sci_flbbcd_cdom_units'; 
    75                 scatter_name   = 'sci_flbbcd_bb_units'; 
     85                chlor_name       = 'sci_flbbcd_chlor_units'; 
     86                cdom_name        = 'sci_flbbcd_cdom_units'; 
     87                scatter_name     = 'sci_flbbcd_bb_units'; 
     88                chlor_sig_name   = 'sci_flbbcd_chlor_sig'; 
     89                cdom_sig_name    = 'sci_flbbcd_cdom_sig'; 
     90                scatter_sig_name = 'sci_flbbcd_bb_sig'; 
     91                chlor_ref_name   = 'sci_flbbcd_chlor_ref'; 
     92                cdom_ref_name    = 'sci_flbbcd_cdom_ref'; 
     93                scatter_ref_name = 'sci_flbbcd_bb_ref'; 
    7694        end 
    7795 
     
    106124                        data.data(:,strmatch(scatter_name,... 
    107125                                             data.vars, 'exact'))]; 
     126                    chlor_sig = [chlor_sig; ... 
     127                        data.data(:,strmatch(chlor_sig_name,... 
     128                                             data.vars, 'exact'))]; 
     129                    cdom_sig = [cdom_sig; ... 
     130                        data.data(:,strmatch(cdom_sig_name,... 
     131                                             data.vars, 'exact'))]; 
     132                    scatter_sig = [scatter_sig; ... 
     133                        data.data(:,strmatch(scatter_sig_name,... 
     134                                             data.vars, 'exact'))]; 
     135                    chlor_ref = [chlor_ref; ... 
     136                        data.data(:,strmatch(chlor_ref_name,... 
     137                                             data.vars, 'exact'))]; 
     138                    cdom_ref = [cdom_ref; ... 
     139                        data.data(:,strmatch(cdom_ref_name,... 
     140                                             data.vars, 'exact'))]; 
     141                    scatter_ref = [scatter_ref; ... 
     142                        data.data(:,strmatch(scatter_ref_name,... 
     143                                             data.vars, 'exact'))]; 
    108144                    ptime_ebd = [ptime_ebd; ... 
    109145                        data.data(:,strmatch('sci_m_present_time',... 
     
    121157        cdom = cdom(i); 
    122158        scatter = scatter(i); 
     159        chlor_sig = chlor_sig(i); 
     160        cdom_sig = cdom_sig(i); 
     161        scatter_sig = scatter_sig(i); 
     162        chlor_ref = chlor_ref(i); 
     163        cdom_ref = cdom_ref(i); 
     164        scatter_ref = scatter_ref(i); 
    123165        ptime_ebd = ptime_ebd(i); 
    124166         
     
    130172        cdom = cdom(I); 
    131173        scatter = scatter(I); 
     174        chlor_sig = chlor_sig(I); 
     175        cdom_sig = cdom_sig(I); 
     176        scatter_sig = scatter_sig(I); 
     177        chlor_ref = chlor_ref(I); 
     178        cdom_ref = cdom_ref(I); 
     179        scatter_ref = scatter_ref(I); 
    132180 
    133181        % convert ptime into datenum style... 
     
    139187            'cdom', 'ppb', ... 
    140188            'scatter', '1/mm', ... 
     189            'chlor_sig', 'count', ... 
     190            'cdom_sig', 'count', ... 
     191            'scatter_sig', 'count', ... 
     192            'chlor_ref', 'count', ... 
     193            'cdom_ref', 'count', ... 
     194            'scatter_ref', 'count', ... 
    141195            'ptime_ebd', 'seconds since 0000-01-01T00:00', ... 
    142196            'ptime_ebd_datenum', 'days since 1970-01-01T00:00'); 
     
    146200            'cdom', 'chromophoric dissolved organic matter', ... 
    147201            'scatter', 'backscatter', ... 
     202            'chlor_sig', 'chlorophyll raw count', ... 
     203            'cdom_sig', 'chromophoric dissolved organic matter raw count', ... 
     204            'scatter_sig', 'backscatter raw count', ... 
     205            'chlor_ref', 'chlorophyll reference count', ... 
     206            'cdom_ref', 'chromophoric dissolved organic matter reference count', ... 
     207            'scatter_ref', 'backscatter reference count', ... 
    148208            'ptime_ebd', 'science computer time', ... 
    149209            'ptime_ebd_datenum', 'science computer date'); 
     
    165225             'cdom', ... 
    166226             'scatter', ... 
     227             'chlor_sig', ... 
     228             'cdom_sig', ... 
     229             'scatter_sig', ... 
     230             'chlor_ref', ... 
     231             'cdom_ref', ... 
     232             'scatter_ref', ... 
    167233             'ptime_ebd', ... 
    168234             'ptime_ebd_datenum');